Program Pendidikan STT Bethany Surabaya

Strata 1 :
S1 Kependetaan  (S.Th) Kelas Pagi (konsentrasi Pastoral dan Misiologi),  Kelas Malam (konsentrasi Pastoral)
S1 Pendidikan Agama Kristen  (S.Pd.K): Kelas Pagi

Strata 2
S2 Magister Artium (MA) Pastoral dengan konsentrasi ministry/penggembalaan
S2 Magister Teologi (M.Th) dengan konsentrasi Teologi Biblikal, Pastoral Konseling dan Misiologi.
S2 Magister Pendidikan Agama Kristen (M.Pdk.) dengan konsentrasi pendidikan  dan Teknologi Pendidikan

Strata 3
S3 Doktor Ministry (D.Min)
S3 Doktor Teologi (D.Th) dengan konsentrasi Teologi biblikal, pendidikan dan misiologi.